陽明交大最新的分部就在臺南的沙崙智慧綠能科學城，從2009年第一棟大樓落成後，目前已有兩座學院與三座大樓，其中智慧科學暨綠能學院又被稱作「AI學院」，規劃62名師資員額，主要目標為培育具有AI理論與實務的人才，涵蓋目前AI產業所需的物聯網、健康照護、綠能、農業、無人機等應用。
陽明交大智慧科學暨綠能學院黃仁竑院長說明，陽明交大在2018年就成立人工智慧普適研究中心，希望將AI技術融入日常生活的應用。這項理念也獲得NVIDIA、友達等企業的支持，在臺南沙崙陸續成立研發與創新中心。目前研究成果逐年成長，在全球各大學資料科學排名上，獲得QS Data Science & AI subject 全球排名62，亦為全國第一。
臺南市政府經濟發展局林榮川局長認為，過去沙崙智慧綠能科學城的籌備辦公室就位於陽明交大臺南分部，市長黃偉哲也曾特別指示市府強化學校周遭包括聯外道路、大眾運輸等建設，並協助與臺南在地業者進行產學合作。如今陽明交大持續提升學術表現，帶動AI相關的應用。
目前AI研究在沙崙科學城相當蓬勃，林榮川局長補充說明，陽明交大的AI學院在許多產業領域已經有顯著成果，例如協助無人機辨識微小物件、於長照機構提供機器人照護、透過農業物聯網預防農產疾病、改善放射性治療掃描影像、都市計畫與與建築設計等。這些在沙崙開發的AI發展解決方案，不僅協助專業人士解決問題，也能因為導入AI，有效降低相關產業的成本。
沙崙智慧綠能科學城辦公室表示，行政院長卓榮泰日前已宣布，臺灣第一個AI產業專區將設置在臺南沙崙。辦公室將遵循中央政策，以全區樞紐推動整合的立場，攜手陽明交大臺南分部，與南市府及各部會合作，爭取研發成果在當地進行落地示範，協助相關AI技術完成實證並與更多民間企業合作，從臺南建立AI生態圈，擴大應用到各縣市與各領域。
