本次山陀兒颱風來襲，警報發布前第一時間，市長黃偉哲要求市府團隊及37區公所嚴陣以待，加強防颱整備工作。鑑於今年7月凱米颱風造成本市多處淹水及道路中斷狀況，特別提醒各區須嚴防強風、強降雨及沿海地區海水暴潮，山區注意土石流，如有土石崩落，由各區開口契約即時搶修；沿海地區之區公所要嚴加戒備留意低窪地區易積淹水的情況，充分使用沙包及防水擋板。
市長黃偉哲也提醒各區水溝、排水孔排除落葉、阻礙排水覆蓋物要特別留意、檢視抽水站功能要維護正常運作。在人員保全方面，請各區公所掌握山區或沿海低窪地區之保全對象，加強儲備物資補足、避難收容處所之整備，並進行超前性預防撤離。在對施工中工程要求監造及施工廠商，加強工地安全措施及巡檢尤其施工中的工地是否影響水流。對於民間建築工地，提前通知建商做好防颱措施；加強防範全市各看板招牌、工地帆布等，各區做好萬全準備，確保市民與家園安全。
民政局長姜淋煌說明，山陀兒颱風來襲前，已嚴格督導各區公所進行整備工作。在沙包與防水擋板等器材備置各區整備沙包總數量超過11萬包，防水擋板數量約3500餘片，民眾颱風襲擊前領取近8萬包，2600餘片。在人員安全保全上，全市有東山區、南化區、龍崎區、楠西區、玉井區、白河區、六甲區、柳營區、鹽水區、麻豆區、將軍區、新化區、安定區、左鎮區等14區464人預防性疏散撤離。本次颱風期間各區公所動員各區里鄰長協助通報、排除及疏散撤離，並感謝國軍動員80兵力協助沙包載運及民眾撤離及慈濟動員志工627人次協助訪視526戶獨老、兩老相依戶。
隨著颱風遠離，各區公所集全所人力及開口契約商的努力下，傾倒路樹與枝葉垃圾的移除已陸續快速完成，還給市民乾淨安全的市容環境。民政局也呼籲市民使用後沙包請妥善保管以備爾後需要或歸還各區公所回收，不得任意丟棄造成環境汙染或排水阻塞。
市長黃偉哲也感謝國軍與水利、環保、社會及民間團體等全力動員，不分日夜進行觀測及協助災民，並呼籲市民朋友，本次颱風所未造成台南市嚴重的災害，但在颱風雨過後容易造成瓶瓶罐罐、掉落帆布等積水情形，因此請市民朋友盡速將家戶周圍環境進行巡倒清刷，落實居家環境孳生源清除，公私合力一同抗疫，一起有效防止登革熱疫情發生。
